Naukowcy poinformowali, że głosy przeciwko użytkowaniu nowoczesnych skanerów ze względu na zagrożenia dla ludzi są nieuprawnione. Promieniowanie jakie emitują urządzenia skanujące jest mniejsze niż to, na które ludzie wystawiani w życiu codziennym. Jednakże mimo niewielkiego zagrożenia IAEA zaleca stałe monitorowanie dawek promieniowania.

- Urządzenia nie szkodzą pasażerom. W czasie skanowania są oni narażeni na dawkę promieniowanie od 0,1 do 5 Sivertów, co nie stanowi żadnego zagrożenia dla ludzkiego zdrowia - powiedziała Renate Czarwinski, dyrektor departamentu IAEA zajmującego się monitorowaniem zagrożeń związanych z promieniowaniem. - Wystawianie człowieka na działanie promieniowania rentgenowskiego powinna być w jakiś sposób uzasadnione. Trzeba rozważyć czy korzyści związane z wprowadzeniem skanerów nie są większe niż prawdopodobne szkody. Korzyści dla bezpieczeństwa są na pewno bardzo wysokie. Dzięki wykorzystaniu urządzeń skanujących służby lotniskowe mogą w porę wykryć ukrytą na ciele broń lub ładunek wybuchowy.

Obecnie istnieją dwa rodzaje urządzeń skanujących całe ciało. Jedno z nich wykorzystuje do skanowania fale radiowe o wysokiej częstotliwości, a drugie natomiast używa do tego celu promieniowania rentgenowskiego ( podobne do tego jakie wykorzystując się w rentgenach medycznych).